高校毕业论文管理信息系统的设计更多是为了方便流程的监督和管理，没能充分考虑大学生在毕业论文撰写和大学老师在毕业论文指导中对于系统的服务需求。学生和教师的线下交流会在其他的系统中进行，没有真实记录学生毕业论文撰写指导过程，不能很好地对教师的绩效进行衡量，反而增加了学生材料整理上传和老师审核的工作量。本文通过对毕业论文指导流程和高校毕业论文管理信息系统的功能现状的分析，发现高校毕业论文管理信息系统中存在的问题，并据此提出毕业论文管理信息系统进一步优化的对策。