《微生物学》是食品科学与工程专业本科生课程知识体系的重要组成部分,是学生学习、理解与掌握微生物学科相关基本概念与知识、基本原理和操作的十分重要的专业基础课程。新冠肺炎疫情迫使部分本科生的课堂教学从线下转到线上,这不仅给较为依赖师生共处面授课堂的传统教学方式带来巨大的挑战,而且对参与课堂学习的学生固有的学习方式也提出了更新的要求。如何在新冠肺炎疫情防控形势下保障《微生物学》课堂教学质量,使每一位学生无论是在线上还是在线下课堂,都能够通过课程内容的学习,达成课程的教学目标,成为授课教师面临的十分严峻的问题。课程组结合数年改革经验,通过立体化教材设计、翻转课堂精细化教、,教与学换位引导等方式,进行了教学方法的实践探索,取得了较好的反响。总结该文,以期为食品专业《微生物学》课程教学改革提供参考。