明清时期是中央王朝治理海南的重要时期,这一时期海南的发展状况呈现出两个特点,一是不断镇压的黎族起义促进了中央王朝在黎族地区和其他少数民族地区治理的不断深入和完善,二是由于海盗和倭寇的袭扰和东南沿海航海贸易的发展,海防意识不断增强。海防和民族治理就成为明清朝廷治理海南的两个重大问题。