分子标记技术具有操作简单、灵敏度高、结果准确等优点,已广泛用于药用植物的相关研究;金钱草具有利湿退黄,利尿通淋和解毒消肿等功效,临床应用广泛,但其地方习用品及市场混用品多样,同名异物、异物同名现象严重,影响临床应用的安全性。为同类研究及临床应用提供参考,概述了DNA条形码、限制性片段长度多态性(RFLP)和扩增片段长度多态性(AFLP)等分子标记技术在药用植物研究上的应用及金钱草的地方习用品与市场混用品、化学成分和药理作用等方面的研究进展,展望了其未来的研究方向。