目的：分析儿童细菌性腹泻的病原微生物检验效果及价值。方法：选取2016年6月至2021年10月本院收治的138例细菌性腹泻患儿为研究对象，所纳入的患儿均采集粪便标本检测，严格按照《全国临床检验操作规程（第四版）》和《细菌鉴定手册》有效检测病原微生物，有针对性地判断细菌耐药性并对病原微生物的分布情况和病原菌药敏实验结果进行分析和总结。结果：通过对采集的粪便样本进行病原微生物分离培养，有效检出病原菌138株，其中，检出率最高的是沙门菌，其次是金黄色葡萄球菌和念珠菌，分析药敏试验结果发现，这些病原菌容易对头孢曲松、头孢他啶、环丙沙星、氨苄西林、复方新诺明产生一定程度的耐药性。结论：在细菌性腹泻患儿诊断中，病原微生物检验具有一定的临床检测效果，同时还能明确相关致病菌的主要分布情况，结合药敏试验，可以为相关患者在临床治疗的过程中提供可靠的治疗依据，满足临床需求。