本文综合以往学者对于创新系统研究的创新结构和创新过程的研究视角，以知识生态系统遵循的DICE运行模式为分析框架建立了包含4个一级指标、7个二级指标、25个三级指标的中小城市国家高新区创新生态系统评价指标体系，最后实证研究了9个中小城市国家高新区，并根据知识分布、知识互动、知识竞争和知识演化4个维度分析了各个国家高新区的创新生态系统发展现状，指出其发展的优点及存在的不足并给出了合理的对策与建议，验证了评价指标体系的合理性和科学性。