目的探讨菌血症临床诊断中血降钙素原与血液细菌培养的应用价值。方法选择该院2019年1—12月收治的2000例菌血症患者,所有患者进行血降钙素原与血液细菌培养的检查,对比检查结果。结果血降钙素原检查阳性1840例,阴性160例。两种方法检测特异度差异无统计学意义（χ2=0.000,P>0.05）,血降钙素原灵敏度高于血液细菌培养,差异有统计学意义（χ2=7.290,P<0.05）,准确率高于血液细菌培养,差异有统计学意义（χ2=8.130,P<0.05）。菌血症患者发热24h的血降钙素原检测阳性1640例（82.00%）高于血液细菌培养840例（42.00%）,差异有统计学意义（χ2=17.290,P<0.05）,48h1840例（92.00%）高于血液细菌培养760例（38.00%）,差异有统计学意义（χ2=10.040,P<0.05）,72h2000例（100.00%）高于血液细菌培养1640例（82.00%）,差异有统计学意义（χ2=4.680,P<0.05）。结论菌血症临床诊断中血降钙素原与血液细菌培养的应用价值显著,二者各有优缺点,临床上需要联合采用两种方法进行优势互补,既要注意检测的效率及时早期采取针对性的抗生素抗菌治疗,也要追踪病原菌的具体类型进行针对性治疗,从而提高对疾病情况的掌握程度,提高临床治疗效果。