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大麻CAMTA转录因子家族基因生物信息学分析
摘 要:
植物钙调素结合转录激活因子(CAMTA)广泛存在于多细胞真核生物中,在植物的生长发育和防御反应中发挥重要的调控作用。对大麻CAMTA家族基因、蛋白及启动子序列进行生物信息学分析。结果表明,大麻基因组中含有5个CsCAMTA基因,基因开放阅读框序列长度在2373~3240bp之间,编码蛋白的氨基酸数量在915~1079之间。CsCAMTA蛋白均为亲水性蛋白,CsCAMTA2蛋白为稳定蛋白,其他CsCAMTA蛋白均为不稳定蛋白。CsCAMTA5蛋白定位在细胞质中,其他CsCAMTA蛋白均定位在细胞核中。CsCAMTA5蛋白中α-螺旋占比最高,其他蛋白中均无规则卷曲占比最高。CsCAMTA家族成员均包含1个CG-1DNA结合结构域、1个TIG结构域和1个ANKYR结构域,且均含有Motif1Motif6。蛋白系统进化分析结果表明,大麻CsCAMTA蛋白与拟南芥AtCAMTA蛋白的亲缘关系较近。5个CsCAMTA基因启动子中均含有不同种类和数量的光、激素及逆境胁迫响应相关的顺式作用元件。
作 者:
  • 计俊杰;马婷婷;马洪宇;高双;李珊珊;赵艳;翟莹
单 位:
    齐齐哈尔大学生命科学与农林学院
关键字:
  • 大麻;钙调素结合转录激活因子;CAMTA基因;生物信息学分析;胁迫;
页 码:
    75-80
出 处:
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