财政专项绩效评价是指对财政资金的项目组织实施、资金分配使用、年度绩效目标完成进展等情况进行客观、科学的评价,它体现在项目预算的编制、执行、监督全过程,在预算管理中具有举足轻重的地位。本文分析高校财政专项资金绩效评价存在的主要问题,并结合高校业务特点提出相应的对策。