当前，集中分布在珠三角各市的大量劳动密集型港资中小企业正面临着发展困境，其转型升级的成败，关乎大湾区经济高质量发展的战略总格局。近年来，随着全球贸易萎缩与国际竞争加剧、外需疲软与用工成本上升等一系列因素，以及新冠疫情、中美贸易摩擦等等一系列重大事件的影响，阻碍了大湾区港资中小企业转型升级。通过构建二元选择概率计量模型的实证表明，具有一定规模和创新能力的港资企业会更为倾向于选择转型升级的战略。最后，提出相关对策建议。