高校自组织在高校网络舆情治理中具有十分重要的作用，其具有开放复杂性、非平衡性、非线性以及涨落和突变等特性。网络自组织与网络舆情治理之间存在内在关联。化解高校舆情治理困境，需要从内外部环境、手段和方法上予以重视和协调。需要加强舆情系统自组织规律的研究，保持舆情系统开放性，培育演化条件；营造良好的外部治理环境，辅以他组织进行调控，降低治理成本；掌握正确手段，直面矛盾和问题，促进监管在引导网络舆情中的“消融”作用；应用科学方法，把握舆情演化的阶段特点，构建多元协调的有效应对机制。