目的研究微创经皮肾穿刺联合第五代混合动力系统（EMS）治疗结石性脓肾的价值。方法以该院2018年5月—2019年7月该院收治的结石性脓肾患者为研究对象68例,根据就诊时间分为研究组与对照组,每组34例。对照组行传统经皮肾穿刺取石。研究组接受微创经皮肾穿刺联合第五代混合动力系统（EMS）治疗。分析两种治疗方法对临床治疗效果、不良反应、临床指征应向。结果研究组上端结石及肾盂结石取净率92.86%,肾脏多发结石及铸型结石取净率55.00%优于对照组（50.00%、62.50%）,差异有统计学意义（χ2=1.580,P<0.05）。对照组总不良反应发生率（44.12%）低于研究组后（8.82%）,差异有统计学意义（χ2=10.880,P<0.05）。研究组手术时间、住院时间均短于对照组,差异有统计学意义（P<0.05）。结论微创经皮肾穿刺联合EMS治疗结石性脓肾应用效果良好,不良反应小、创伤小,结石取净率高,治疗方法安全、可靠。同时,能够及时解除梗阻稳,通畅引流,控制感染,尽可能恢复肾功能。