肿瘤细胞异质性是传统癌症治疗手段效果不理想的重要原因，传统基因检测方法并不能深入到单细胞层面，但单细胞测序技术可以检测多个单细胞遗传信息以及基因表达调控差异。乳腺癌作为一种具有高度异质性的肿瘤，具有代表性。本文以乳腺癌为例，主要概述了单细胞测序过程中的单细胞分离，基因组、转录组测序技术，并分析乳腺癌各种亚型和治疗方法，提出一些防治肿瘤的新思路。