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基于网络生物信息学筛选精神分裂症关键基因
摘 要:
目的利用生物信息学方法筛选参与精神分裂症发病机制的关键基因。方法以schizophrenia为关键词,在大鼠基因组数据库(RGD)检索人精神分裂症相关编码基因,从生物学过程、细胞组成、分子功能三个方面分别对其进行富集分析和京都基因与基因组百科全书信号通路富集分析,然后通过构建蛋白-蛋白互作网络找到联系程度紧密的基因,通过cytosacpe软件筛选核心关键基因。结果共检索到391个人源精神分裂症相关编码基因;这些基因主要参与STAT蛋白磷酸化、细胞和体液免疫反应、B细胞分化和增殖等生物学过程,分布于细胞连接处、神经元上、突触小泡、胞质膜的锚定成分,并主要富集于胞质DNA传感途径、RLR信号通路、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、TOLL样受体信号通路;蛋白互作网络分析共筛选出DTNBP1、DAO、DRD2、DISC1、NRG1、ZDHHC8等6个关键基因。结论免疫炎症反应和精神分裂症的病理机制密切相关,后续研究值得关注的通路包括TOLL样受体信号通路和NRG1信号通路,而DTNBP1和ZDHHC8与精神分裂症的直接关系还有待进一步研究。
作 者:
  • 吴亚娟;赵楠;钱科佳;惠涛;潘继英;
单 位:
    张家港市第四人民医院精神科
关键字:
  • 精神分裂症;关键基因;信号通路;免疫反应;
页 码:
    1-5
出 处:
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