随着全过程预算管理的不断推进，高校不断探索对预算管理绩效评价机制的研究，以此提高资源配置和资金使用效率，缓解资金短缺与学校发展需求的矛盾。但在预算绩效管理进一步实施过程中，仍然在指标选择、评价体系、结果应用等方面存在一定问题。通过对高校预算绩效现状进行分析，并从指标选择、评价体系设置、绩效监督机制、评估结果应用等方面提出相应的完善建议，构建更为系统科学、符合预期目标的预算管理绩效评价机制。