随着国家对科技工作的日益重视和科技投入的明显增大，财政科研资金投入的效果也越来越受到政府和民众的关注，加强对财政科研资金的管理，提高使用效率是政府不断追求的目标。针对科研项目建立预算绩效评价指标体系，开展积极有效的绩效评价，不仅可以提升财政科研资金的使用效率，也成为促进科研项目组织管理水平和实施成效提升的重要方式。本文首先对我国科研项目绩效评价指标体系的现状及问题进行了分析，进而介绍了科研项目绩效指标设计的思路和方法，最后用实例说明分项目类别的个性指标，希望能够为相关工作提供参考。