大数据背景下医院病历档案管理面临一系列问题，电子病历档案价值没有得到发挥，电子病历档案同步化不到位，病历档案存储方式不规范，患者病历档案隐私权保护机制缺乏；大数据背景下加强医院病历档案管理，必须建立数字病历档案室，推动医院病历档案数字化建设进程；规范患者病历档案管理制度，实现病历档案管理标准化；加大资金投入，建设专业档案管理队伍；改进档案安全管理机制，加强预警控制，提高电子档案的安全性。