目的：探讨补肾温阳化瘀汤配合灌肠治疗子宫内膜异位症的临床效果。方法：选取我院2014年1月—2016年10月收治的60例子宫内膜异位症患者作为研究对象，随机分为研究组和对照组，各30例。分别采用我院自拟补肾温阳化瘀汤配合灌肠进行治疗和给予西药治疗，观察复发情况，痛经，血清中CA125值。结果：研究组总有效率明显高于对照组（P<0.05）；治疗后，两组VAS评分均较治疗前显著下降（P<0.05）；治疗后两组VAS评分差异有统计学意义（P<0.05）；治疗后，两组CA125值相比治疗前均差异有统计学意义（P<0.05）；治疗后研究组CA125值下降率显著高于对照组（P<0.05）；研究组复发率显著低于对照组（P<0.05）。结论：我院自拟补肾温阳化瘀汤配合灌肠治疗子宫内膜异位症疗效显著，值得临床推广。