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生物信息学探究lncRNA CASC9在肝细胞癌中的功能及作用机制
摘 要:
目的探讨肝细胞癌(HCC)组织中长链非编码RNA(lncRNA)肿瘤易感性候选基因9(CASC9)的表达及其与临床预后的关系,并对CASC9靶基因进行系统的生物信息学分析。方法使用生物信息分析方法了解CASC9的基本信息与生物学功能;使用TCGA数据库数据,比较HCC组织和癌旁正常组织中CASC9表达量,并分析其与HCC预后的相关性;使用lnCAR数据库和Metascape工具对CASC9的靶基因进行预测及功能富集分析,并筛选出CASC9相互作用的miRNA和关键靶基因。结果与癌旁正常组织相比,CASC9在HCC组织中呈高表达(P<0.05)。生存分析显示,HCC组织中CASC9高表达与HCC患者的不良预后显著相关(P<0.05)。KEGG分析显示,CASC9与脂肪酸代谢、嘌呤代谢、MAPK信号通路、Jak-STAT信号通路、细胞周期等信号通路相关。GO富集分析结果显示,CASC9与细胞核分裂、细胞周期调控、细胞周期检查点等多种途经相关。结论CASC9可作为一种原癌基因参与HCC的发生、发展,并具有成为HCC诊断标志物、预后指标及治疗靶点的潜在价值。
作 者:
  • 陈文琦;严倩;李珊珊;罗敏;景海曼;韩颖;周勇;关新元;
单 位:
    香港大学深圳医院肿瘤科
关键字:
  • 肝细胞癌;长链非编码RNA;肿瘤易感性候选基因9;
页 码:
    19-23
出 处:
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