目的通过转录组测序以及生物信息学分析对CUG2的下游差异性表达基因进行功能分析,探讨CUG2在肝癌发生、发展过程中的分子机制及作用。方法将CUG2siRNA转染入肝癌细胞HepG2与Huh7,采用RNA-Seq技术筛选CUG2的下游差异表达基因;利用DAVID和STRING数据库分析差异性表达基因功能、信号通路和蛋白相互作用,确定CUG2下游靶基因。采用Kaplan-Meier曲线和Cox回归分析靶点蛋白在生存预后分析中的价值。结果HepG2细胞敲降CUG2后有420个基因上调,367个基因下调;Huh7细胞敲降CUG2后有2376个基因上调,1799个基因下调。FGB、GC、CENPF、CENPP、TOP2A、PGK1、EPO、CXCL1、CXCL8和KLF2均为CUG2的下游靶基因,生物信息学分析发现这些靶点蛋白与肝癌患者生存预后相关。结论肝癌发生、发展过程涉及多个与癌症相关的生物学过程和信号通路的改变,CUG2的下游作用靶点与肝癌患者的生存预后相关。