目的利用生物信息学分析初步
探索颈动脉粥样硬化进展的枢纽基因和关键通路。方法从GEO
数据库获得颈动脉斑块的基因表达谱GSE43292数据集,利用GEO2R分析颈动脉斑块和正常组织的差异基因,利用R语言clusterprofile包对差异基因进行GO富集分析和KEGG功能富集分析。利用STRING工具和Cytoscape构建蛋白互作网络,并筛选关键基因。结果GEO2R分析GSE43292数据集共含有97个差异基因,包括46个上调基因和51个下调基因;基因富集分析发现差异基因主要富集cAMP信号通路、色氨酸代谢、PPAR信号通路等相关通路。差异基因蛋白互作网络的枢纽基因为CD163、MMP9、CXCL10、CCR1。结论CD163、MMP9、CXCL10、CCR1为颈动脉斑块形成的枢纽基因,可能为动脉粥样斑块的预后和治疗提供新的分子靶点。