菌株是微生物实验室检验期间很关键及常见的生物资源种类，菌株时常被应用在培养基验收以及试验对照、人员的考核、培训，还有方法的确认等相关质量管理工作中。所以，为了保证工作菌株的质量，保持良好的纯度与生物特性，实现对工作株迅速和快捷的使用与溯源，要优先做好菌种的一系列管理工作。结合实际来说，菌种的管理工作作为微生物实验室的主要工作内容人们不可忽视，在管理期间依据统一的操作程序来制备菌株，能够确保微生物试验结果的精准性与一致性。本文探析了食品微生物实验室标准菌株管理常见问题与改进举措，分析过程中针对菌株微生物实验室管理的现状、不足，提出有效解决举措及菌株管理的方案，力求为相关单位及其管理工作人员具体工作提供有效资料和可靠结论作为参考。