现行医疗体制改革形势下,医药流通中的药品数量增多,范围扩大。为适应当前的社会发展趋势和要求,提高市场竞争力,医药流通企业必须加快财务管理信息化进程,对财务管理信息结构进行最大化的使用,为公司管理者提供有效的财务数据信息,确保公司采购流程的及时更新。但就目前医药流通企业财务管理信息化建设的运行状况而言,还存在一定的了弊端。文章主要分析医药流通企业财务管理信息化建设中存在的问题,并提出具体解决措施。