管风琴是伴随着基督教士在闽传教而萌芽、发展、繁荣起来的。结合不同时期的历史背景，管风琴在福建的发展历经四个阶段：首先，伴随基督教四次入华传教，管风琴在福建昙花一现，为其后管风琴在福建萌芽奠定了基础；其次，具有闽南特征的方言圣诗出现，管风琴为唱诗班伴奏，管风琴在福建初步萌芽；第三，管风琴依旧为唱诗班伴奏，但采用了普通话圣歌，是管风琴在福建进一步发展；最后，管风琴历经前三个时期，在这一时期伴随着社会的发展，历史背景的改变加之普通话在教会中作用逐渐扩大，管风琴有了突破性的发展，并不局限于在教堂中使用，而在世俗中使用开来并演奏通俗乐曲。