以2009-2021年长江经济带省域面板数据为基础，采用空间杜宾模型、内生增长数理模型，运用动态最优化分析方法及中介效应模型探究绿色科技创新是否对长江经济带农业绿色全要素生产率产生影响，并分析其影响路径。研究表明：绿色科技创新可以促进长江经济带农业绿色全要素生产率的提升，直接效应为正，但间接效应不显著；良好的财政政策可以引导农业生产良性发展；农村教育程度越高，越有助于农业绿色全要素生产率的提升；产业结构完善和优化受绿色科技创新的影响，且对农业绿色全要素生产率的提升形成部分中介作用。