在经济发展新常态背景下，医药企业发展面临着越来越激烈的市场竞争，同时内部经营管理的压力越来越大。如今，医药企业内部控制和财务管理信息化，是提高企业效益和市场竞争力的关键，意味着要对传统内控及财务管理模式进行优化。文章以医药批发企业的内部控制为研究内容，阐述了传统医药企业在内部控制和财务管理信息化方面存在的问题，针对这些问题，分析了内部控制及财务管理信息化的基本要点，证明了内控机制优化和财务管理信息化，对提高医药企业市场竞争力有重要意义。