随着政府会计准则的不断优化，政府会计实物操作的在财务共享一体化的大形势下，现行的预算会计和财务会计也要跟上时代的步伐，适应现代社会的发展，为公共事业提供更有价值的信息，其不断的改革就势在必行。以权责发生制为代表的财务会计和以收付实现制为代表的预算会计在新会计准则的指引下,在同步进行的现状下，这就增加了核算和统计的复杂性。在行政事业单位为主体核算的财政预算管理体制下，在各种辅助工具的大力协同下，如何实现会计信息的提取的高质量发展，已达到各个政府部门及事业单位在会计数据方面的需求，即有原则性又有灵活性，又不会削弱预算会计在核算中的重要性，这是下一步在共同发展的结合性的进一步延伸。此文通过分析比较公益类事业单位预算会计与公益类事业单位财务会计在会计核算中的联系与区别，新政府会计制度下的财务会计与预算会计在提供会计信息方面,以及会计信息使用者以及会计基础等方面存在着差异，而这些差异主要是两者所关注的重点不一样所造成的，两者同时也存在着联系，联系主要体现在两者从不同维度为会计信息使用者提供了信息，从建立完善的预算会计体系、强化监控和确保信息内容方面入手分析在不同核算过程中所存在的差异化以及在完成整个会计核算工作所又走向趋同的路径，持续推进预算会计与财务会计有效兼容结合。