财政政策在应对经济下行方面发挥了重要调节作用。但是，伴随着财政政策频繁调整，也加大了财政政策的不确定性，直接影响到市场主体的未来预期，进而对企业创新行为产生影响。以上市公司为样本，探讨了财政政策不确定性与企业创新之间的关系。研究发现，财政政策不确定性对企业创新数量和质量均有一定的促进作用。进一步分析表明，风险偏好程度较低企业和高新技术企业的创新行为受财政政策不确定性影响更大。机制检验表明财政政策不确定性可以通过提高管理层心理预期、降低企业金融化来促进企业创新。对此，政府可以通过引导企业由“策略性创新”向“实质性创新”转变、大力提升财政透明度、加快融资体制改革等手段来提升企业创新水平。