在能力建设与海洋技术转让合作方面的主要争点在于合作的法律依据是采用《公约》还是BBNJ协定、是否应将合作确立为一项义务进行规定即合作的自愿性与强制性、合作参与者是否包括私营企业、以及合作资金采取强制性还是自愿性、是否特别考虑广大发展中国家情况等。通过对其他国际条约能力建设与海洋技术转让合作经验的借鉴,并且结合当前发达国家与发展中国家间的利益权衡,应当将新国际协定作为法律依据并确立合作义务,吸纳私营主体参与合作。同时,要采用强制性与自愿性相结合的资金机制,充分考虑发展中国家的特殊情况进行合作。