红色档案是高校开展爱国主义教育的重要资源、重要基地、重要方式，挖掘红色档案，探索教育方法，传承红色基因，对红色档案融入高校爱国主义教育具有重要意义。目前，红色档案融入高校爱国主义教育，存在红色档案的开发利用、教育形式、内容挖掘、实践效果等难点。重视红色档案的开发利用、构建校际共享矩阵、拓展教育形式、多元主体参与是红色档案融入高校爱国主义教育的路径。