目的研究甲巯咪唑与丙硫氧嘧啶对甲亢患者促甲状腺素（TSH）、游离甲状腺素（FT4）、游离三碘甲状腺原氨酸（FT3）水平的影响及安全性。方法回顾性分析贵阳市花溪区人民医院2018年4月至2020年2月收治的60例甲亢患者的临床资料,按治疗方式分组,其中30例接受甲硫咪唑治疗患者为A组,另30例接受丙硫氧嘧啶治疗患者为B组,两组患者均治疗3个月。对比两组患者治疗后临床疗效;对比两组患者治疗前后血清TSH、FT4、FT3水平;对比两组患者治疗期间不良反应发生情况。结果治疗后A组患者临床总有效率（93.33%）高于B组患者（70.00%）;与治疗前比,治疗后两组患者TSH水平升高,且A组高于B组;两组患者血清FT4、FT3水平下降,且A组低于B组;治疗期间A组患者不良反应总发生率高于B组（均P<0.05）结论甲硫咪唑与丙硫氧嘧啶相比,甲硫咪唑临床疗效更好,可更有效地恢复患者甲状腺功能,但不良反应较多,治疗期间应注意预防。