《政府会计制度》在公立医院全面实施的两年中,基本实现了医院会计制度的有效转型,但却暴露了一些具体问题,诸如科研经费的核算问题、平行记账的特别问题、计提资产损失问题、非同级政府拨款收入问题、使用财政资金购买固定资产折旧处理等问题,一定程度上影响了《政府会计制度》的有效实施。对这些问题的进一步研究,既有利于《政府会计制度》自身的完善,又有利于医院在具体实施中的有效运行。