本研究从国家政策、国际对比等角度出发,在内控视角下分析高校与政府的关系,研究发现高校与政府的关系最主要的是合作和互补关系。本研究分析了当前高校-政府合作的四个困境,分别是:缺乏质量高效果好的合作平台、缺乏有效的体制机制、高校的角色定位不明确、政府管理方式的问题。提出高校与政府建设协同创新的合作机制的建议。