本文将全面预算管理理论和科研事业单位预算实践相结合,以科研事业单位的实际情况为出发点,通过重建全面预算架构体系、梳理和重构预算编制流程、提升预算信息化能力以及探索预算考核措施等方面采取优化措施,构建以战略管理为导向的,适应科研事业单位需求的全面预算管理体系,可以使科研事业单位的全面预算管理能力得到显著提高。研究中提出的科研事业单位全面预算存在的问题是众多科研事业单位共同面对的,提出相应的优化构建措施具有借鉴意义,对科研事业单位完善全面预算管理具有很好的实践参考价值。