目的探讨保留括约肌手术治疗肛瘘的临床效果。方法选取2017年1月～2019年7月深圳市宝安区福永人民医院收治的50例肛瘘患者作为研究对象,按照随机分组法分为对照组(25例)与研究组(25例)。对照组采用一次切开挂线术治疗,研究组实施黏膜下移保留括约肌手术治疗。比较两组的一次性治愈率,术后肛门疼痛、肛缘水肿评分,并发症总发生率,手术操作时间及住院时间。结果研究组的一次性治愈率高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05),研究组的术后肛门疼痛及肛缘水肿评分低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05),研究组的术后并发症总发生率低于对照组,手术操作时间及术后住院时间短于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论肛瘘患者治疗黏膜下移保留括约肌术治疗能有效提升手术质量及治疗效果,缓解术后不适感受,降低术后并发症发生率,同时能优化手术流程,缩短治疗及住院时间,值得推广应用。