随着近些年来我国的经济发展水平不断提升以及行政事业的改革不断完善,我们国家对于行政事业单位的管理水平也在不断的提升,如何有效的提升对于行政事业单位的管理效率和质量已经成为了社会广泛关注的焦点。加强内部控制的建设目前来看是一种切实有效的途径,能够真真正正的提升行政事业内部的控制,这也对促进我国行政事业单位的长期健康发展起着至关重要的推动作用,当然就目前的实际情况进行分析不难发现,现在的行政事业单位在内部的控制过程中审计还是或多或少的存在一些问题,只有针对这些问题采取一些切实有效的手段才能够保障后续一系列工作的有序开展。本文将重点探讨行政事业单位内部控制的审计问题,根据现在存在的一些问题采取一系列切实有效的应对措施,为我国的行政事业单位内部审计的长期健康发展打下坚实的基础。