目的：对疾病预防控制机构微生物检验质量与控制管理进行分析，并评价效果。方法：2020年1—12月，挑选126例微生物检验样本，随机分成两组，研究组63例，进行微生物检验质量与控制管理，对照组63例，现有管理措施，比较工作质量、不良问题和结果准确率。结果：与对照组相比，研究组工作质量、不良问题和结果准确率明显更优，差异且有统计学意义（P＜0.05）。结论：对疾病预防控制机构微生物检验质量进行控制管理，可以提高工作质量，减少不良问题的发生，提高检验结果的准确性，效果显著，具有实践意义。